בכל מחוז של הסניגוריה הציבורית קיימת מחלקת מעצרים.

המחלקה אחראית על כל הכרוך בייצוגם של העצורים על-ידי סניגורים ציבוריים, ובכלל זה על בחירתם של הסניגורים הממונים לייצג עצורים, מערך התורנויות והכוננויות בבתי המשפט במחוז ושיבוץ התורנים, פיקוח על הייצוג הניתן לעצורים בתחנות המשטרה ובבתי משפט וכן ארגון השתלמויות בנושא ייצוג עצורים.

מחלקות המעצרים אף נמצאות בקשר שוטף עם המשטרה בכל הנוגע לקיום הוראות חוק המעצרים.

חברי המחלקות עורכים ביקורות תקופתיות בבתי הסוהר ובמתקני מעצר משטרתיים ומעבירים דו"חות על תנאי המעצר לגורמים הרלבנטיים וכן מנהלים מעקב אחר מקרי מוות של עצורים ואסירים במתקני מעצר ומאסר ומעקב אחר הגשת תלונות למח"ש במקרים המתאימים.

עילות הזכאות לייצוג עצורים מפורטות בעיקרן בסעיף 18 לחוק הסניגוריה הציבורית.

הקשר הראשוני בין עצורים  לבין הסניגוריה הציבורית מתבצע בתחנות המשטרה, בבתי מעצר ובבית המשפט באמצעות סניגורים ציבוריים תורנים.