המחלקה למשפט עברי פועלת ליישום חוק יסודות המשפט, התש"ם-1980, הקובע זיקה בין המשפט הישראלי לבין "עקרונות החירות, הצדק, היושר והשלום של מורשת ישראל". ראש תחום משפט עברי, ד"ר מיכאל ויגודה, מופיע בפני ועדות שרים וועדות הכנסת ונוטל חלק בדיונים המתקיימים במשרד המשפטים ובצוותים בין-משרדיים כדי להביא בפניהם את עמדת המשפט העברי בסוגיות העומדות על הפרק.

בנוסף לכך, פעילות המחלקה כוללת:

א.   כתיבת חוות דעת כחלק מתהליך החקיקה, הכנת טיעונים בפני בתי המשפט וייעוץ למשרדי הממשלה ולוועדות הכנסת.

ב.    עריכה שיטתית ועדכנית של המשפט העברי כיסוד לחקיקה ולפסיקה על פי סדר חוקי מדינת ישראל, במסגרת סדרת הספרים "חוק לישראל", היוצאת לאור בשיתוף עמותת "מורשת המשפט בישראל".

ג.     עריכת השתלמויות, שיעורים, סמינריונים וימי  עיון לשופטים ולעורכי דין.  

ד. מדי שבוע, מפרסמת המחלקה, בשיתוף  המרכז להוראת המשפט העברי ולימודו שבמכללת "שערי משפט", גיליון משפטי, פרשת השבוע, המשלב משפט עברי ומשפט ישראלי בזיקה לפרשת השבוע.