בראש המחלקה המשפטית של משרד המשפטים עומד היועץ המשפטי למשרד והוא אחראי על ארבעה תחומי פעילות עיקריים (תתי יחידות):

1.       המחלקה המשפטית - יעוץ משפטי למשרד הממשלתי בהיותו משרד ממשלתי וכפי המקובל בכל משרד ממשלתי.

2.       בתי הדין לביקורת משמורת של שוהים בלתי חוקיים.

3.       הטיפול בהליכי הבחירה והמינוי של חברים לגופים וטריבונלים שונים שבמינוי השר.

4.       נושא העדות הנוצריות והמרות דת.

היועץ המשפטי למשרד המשפטים הוא עו"ד משה דיין.