התרחבות המינהל הממלכתי,והתחזקות זיקת האזרח למינהל כתוצאה מקבלת מגוון רחב של שירותים במשרד המשפטים, הרבו מטבע הדברים את נקודות החיכוך בין האזרח לבין יחידות המשרד השונות.

המבקר הפנימי משמש גורם אובייקטיבי שיסייע ל"אזרח הקטן" למצוא דרכו במבוך הבירוקרטיה ולהגן עליו מפני פגיעה של יחידות המשרד בין אם ביודעין ובין אם בשגגה מתוקף היותן נותנות שירות.המבקר משמש כתובת לכל אדם המבקש להגיש תלונה על גורם כלשהו במשרד המשפטים.

-  תלונה מגורם חיצוני – אזרח.

- תלונה מגורם פנימי במשרד – עובד .

-  תלונה אנונימית.

תחום העניינים עליהם אפשר להגיש תלונה הוא רחב. ניתן להגיש תלונה על כל מעשה שנעשה בניגוד לחוק או ללא סמכות חוקית או בניגוד לכללי המינהל התקין, או על כל מעשה שיש בו משום נוקשות יתירה, או משום אי – צדק בולט. לעניין זה "מעשה" הוא גם מחדל או פיגור בעשייה.הנילון חייב להיות אחד הגופים הנתונים לביקורתו של המבקר הפנימי במשרד המשפטים, קרי, יחידות המשרד או עובדיו.

כל אדם רשאי להגיש תלונה למחלקה לביקורת פנימית במשרד המשפטים. עליו לחתום על התלונה ולציין בה את שמו וכתובתו על מנת שיוכל לזכות בתשובה,להוציא מקרים של תלונה אנונימית.

תלונה ניתן להגיש גם בעל – פה במשרד המבקר הפנימי במשרד המשפטים.